More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4612 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  100 
 
 		 531 aa  1008    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  43.65 
 
 		 533 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  41.15 
 
 		 479 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  38.43 
 
 		 568 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  33.53 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  29.39 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  30.88 
 
 		 518 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  36.16 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.73 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2054  CheW protein  32.96 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.83 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.26 
 
 		 163 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  39.46 
 
 		 163 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.37 
 
 		 163 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.91 
 
 		 165 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  42.59 
 
 		 158 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.03 
 
 		 183 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.91 
 
 		 164 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.67 
 
 		 158 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.43 
 
 		 159 aa  101  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.59 
 
 		 158 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.99 
 
 		 162 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  43.52 
 
 		 169 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.81 
 
 		 159 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.96 
 
 		 167 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35.57 
 
 		 168 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.35 
 
 		 168 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.67 
 
 		 158 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.74 
 
 		 189 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.62 
 
 		 164 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  35.1 
 
 		 164 aa  97.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  38.51 
 
 		 162 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.76 
 
 		 167 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.01 
 
 		 164 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  35.9 
 
 		 164 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  35.4 
 
 		 175 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  39.62 
 
 		 166 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 		 163 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.42 
 
 		 161 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.73 
 
 		 165 aa  95.1  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  35.37 
 
 		 164 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  94.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  94  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40.19 
 
 		 165 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.99 
 
 		 177 aa  93.6  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.99 
 
 		 171 aa  93.6  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.99 
 
 		 177 aa  93.6  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.5 
 
 		 174 aa  93.6  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.99 
 
 		 171 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 170 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.29 
 
 		 163 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  42.2 
 
 		 179 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.93 
 
 		 174 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  31.76 
 
 		 165 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  36.49 
 
 		 163 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  37.33 
 
 		 158 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.81 
 
 		 171 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36 
 
 		 174 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  35.97 
 
 		 183 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  36.49 
 
 		 163 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.04 
 
 		 163 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 164 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.81 
 
 		 171 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  32.67 
 
 		 192 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.55 
 
 		 164 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.67 
 
 		 171 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.14 
 
 		 159 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.9  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 		 158 aa  90.9  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 166 aa  90.9  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  39.09 
 
 		 160 aa  90.5  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 163 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.11 
 
 		 159 aa  90.1  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38.14 
 
 		 165 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  41.28 
 
 		 179 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.74 
 
 		 147 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  41.28 
 
 		 179 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>