More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1481 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  61.24 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  53.39 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  54.58 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  52.51 
 
 		 303 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  52.51 
 
 		 303 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  52.51 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  54.3 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.33 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  54.2 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.78 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  54.23 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  51.97 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  51.39 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  52.81 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  52.81 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50.2 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.99 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.02 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  55.51 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  51.15 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.17 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.59 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  53.33 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.59 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.21 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.58 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.25 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.01 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.81 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  52.16 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.53 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.75 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  53.6 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.97 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.2 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.44 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  54.29 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  54.58 
 
 		 259 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 259 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  50.19 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.79 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  52.38 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50.58 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  50.19 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  50.19 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.4 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  51.44 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  51.19 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.22 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  50.19 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 253 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.25 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  49.38 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.34 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.83 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.22 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  46.79 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.99 
 
 		 259 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.76 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.13 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  48.81 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.82 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.22 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.05 
 
 		 267 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  55.31 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  45.79 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.45 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.18 
 
 		 278 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.39 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.4 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.18 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  47.2 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>