87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1494 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  100 
 
 		 312 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  74.39 
 
 		 301 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  67.7 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  67.8 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  58.22 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  61.06 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  61.06 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  61.06 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  61.88 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  63.41 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  66.67 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  68.05 
 
 		 302 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  65.2 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  60.4 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  60.61 
 
 		 298 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  60.51 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  53.33 
 
 		 291 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  53.87 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  48.14 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  44.31 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  47.8 
 
 		 495 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  42.9 
 
 		 429 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  44.29 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  45.52 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  45.74 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  41.28 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  44.44 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  47.74 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  41.79 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  44.33 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  42.32 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  41.99 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  41.77 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  41.64 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  44.64 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  38.42 
 
 		 347 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  45.81 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  47.29 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  45.81 
 
 		 237 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  45.81 
 
 		 237 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  50 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  51.35 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  41.67 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  50.81 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  35.98 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  48.24 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  44.55 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  44.29 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  46.34 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  39.49 
 
 		 351 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  46.31 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  46.5 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  42.2 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  39.81 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  43.66 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  46.63 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  37.15 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  39.66 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  39.66 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  37.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  38.38 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  38.32 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  43.67 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  41.67 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  41.29 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  37.32 
 
 		 237 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  37.38 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  32.42 
 
 		 384 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  30.21 
 
 		 354 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  34.63 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  32.51 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  23.9 
 
 		 803 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  25.37 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1064 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  50.79 
 
 		 669 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  46.55 
 
 		 619 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  62.79 
 
 		 671 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  62.79 
 
 		 652 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  62.79 
 
 		 652 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  49.12 
 
 		 605 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  39.51 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5181  hypothetical protein  65.52 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  42.37 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0016  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.157597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0014  hypothetical protein  66.67 
 
 		 113 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00739134  normal  0.0662412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0014  hypothetical protein  66.67 
 
 		 113 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  40.54 
 
 		 607 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>