62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2931 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  28.57 
 
 
341 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  28.22 
 
 
403 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  29.85 
 
 
313 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  27.32 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  26.42 
 
 
398 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  29.44 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  26.48 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  26.24 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  26.73 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  26.11 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  26.24 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  25.13 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  25.46 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  26.24 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  28.64 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  24.14 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  28.06 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  25.37 
 
 
312 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  26.19 
 
 
353 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  25.62 
 
 
341 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  23.79 
 
 
301 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  28.06 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  26.67 
 
 
318 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  21.29 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  22.96 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  28.29 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  22.28 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  22.39 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  22.33 
 
 
369 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  24.64 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  21.84 
 
 
311 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  25.27 
 
 
288 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  25.12 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  25.31 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  22.77 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  25.12 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  24.15 
 
 
351 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  25.12 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  21.95 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  24.48 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  22.17 
 
 
323 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  24.59 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  23.79 
 
 
371 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  26.9 
 
 
368 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  27.41 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  25.52 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  21.63 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  20.39 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  20.39 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  20.39 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  25.81 
 
 
343 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  21.62 
 
 
337 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  22.33 
 
 
363 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  22.6 
 
 
495 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  25.25 
 
 
326 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  22.12 
 
 
346 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  21.08 
 
 
429 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  23.67 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  25.36 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  21.08 
 
 
421 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  24.64 
 
 
289 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>