188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0656 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  83.08 
 
 
65 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
65 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
65 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
65 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
83 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 
65 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
65 aa  80.5  8e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  53.85 
 
 
65 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  53.85 
 
 
65 aa  79  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
65 aa  74.7  4e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
64 aa  65.5  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
65 aa  63.9  6e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 
65 aa  63.5  9e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
64 aa  62  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 
65 aa  61.2  4e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  48.33 
 
 
67 aa  61.2  5e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 
65 aa  60.5  8e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
65 aa  59.7  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50.88 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
69 aa  59.7  1e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
66 aa  58.2  4e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
64 aa  58.2  4e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
79 aa  57.8  4e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
66 aa  57.8  5e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
66 aa  57.4  6e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
63 aa  57.4  6e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
63 aa  57.4  6e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
66 aa  57.4  7e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
66 aa  57.4  7e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
66 aa  57  8e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
69 aa  56.2  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  46.55 
 
 
155 aa  56.6  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
68 aa  56.2  2e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 
66 aa  55.5  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
73 aa  55.1  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
67 aa  55.1  4e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  44.83 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
64 aa  54.3  6e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 
64 aa  53.5  8e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  42.37 
 
 
78 aa  53.9  8e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  39.66 
 
 
65 aa  53.5  9e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 
56 aa  53.5  9e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  47.17 
 
 
70 aa  53.5  9e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
66 aa  53.5  1e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
66 aa  53.5  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
66 aa  52.8  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
72 aa  53.1  1e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
66 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
68 aa  52.8  2e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  45.28 
 
 
70 aa  52.4  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  36.07 
 
 
66 aa  52.4  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2540  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  0.184829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
81 aa  52  3e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
70 aa  51.6  3e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.54 
 
 
86 aa  52  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
70 aa  51.6  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  32.31 
 
 
75 aa  51.6  3e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
66 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  3.08968e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
66 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
73 aa  51.2  4e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  36.07 
 
 
81 aa  50.4  8e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
80 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  43.33 
 
 
68 aa  49.7  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
70 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
73 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
76 aa  49.7  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.96109e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
63 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
69 aa  48.9  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
64 aa  48.9  2e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
63 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
75 aa  49.3  2e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
100 aa  48.1  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
71 aa  48.1  4e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  39.68 
 
 
109 aa  47.8  5e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
65 aa  47.8  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
133 aa  47.8  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
108 aa  47.4  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
76 aa  47  8e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
69 aa  47  8e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
69 aa  47  9e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
762 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  2.5433e-15 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
767 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72293e-11 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
762 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  1.19248e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  36.67 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
762 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  3.69581e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  43.86 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>