75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0557 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 56 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  83.33 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  50.94 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  52.83 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  48.08 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  48.08 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  48.08 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  48.08 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  44.23 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  41.51 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40.74 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.3 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  43.4 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  42.31 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  47.17 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  46.3 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  43.4 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  40.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  39.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  33.96 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 850 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.74 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  33.96 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.64 
 
 		 79 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>