276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1276 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1109  preprotein translocase, YajC subunit  98.15 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0033679  normal  0.183773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  66.97 
 
 		 110 aa  137  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  43.4 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  41.82 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  38.18 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  36.11 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  45.45 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  34.55 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  39.45 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40.59 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40.59 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.59 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 111 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  43.62 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  42.27 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  42.27 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  44.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  37.25 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  37.25 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  37.25 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  41.07 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  37.38 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  45.24 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.82 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  38.18 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.48 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>