40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3994 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  100 
 
 		 358 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  95.52 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  94.78 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  95.49 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  58.15 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  82.09 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  82.09 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  61.03 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  92.55 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  83.95 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  82.72 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  32.1 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  42.15 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  33.09 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  28.65 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  27.61 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  38.04 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  31.2 
 
 		 2196 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  29.82 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.9 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.18 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  54.39 
 
 		 914 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.57 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  28.89 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.86 
 
 		 925 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.67 
 
 		 964 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  27.45 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  21.94 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  21.94 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  41.33 
 
 		 959 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  48.15 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0053  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0301196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  41.33 
 
 		 990 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  31.25 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  41.53 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  28.64 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  41.53 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  31.03 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  38.38 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>