More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2035 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  83.23 
 
 
310 aa  517  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  83.55 
 
 
310 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  69.35 
 
 
315 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  62.18 
 
 
312 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  61.22 
 
 
312 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  60.06 
 
 
312 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  55.24 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  56.74 
 
 
323 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  46.75 
 
 
316 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  46.5 
 
 
319 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  45.78 
 
 
322 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  45.86 
 
 
312 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  41.61 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 
306 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  39.23 
 
 
306 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  43.23 
 
 
306 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  38.39 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  40.97 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  38.06 
 
 
308 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  40.19 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  37.42 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  36.45 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.59 
 
 
306 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.26 
 
 
308 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 
308 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  40.19 
 
 
309 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.51 
 
 
315 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  37.78 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.5 
 
 
321 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.69 
 
 
322 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  36.1 
 
 
329 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 
320 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  39.62 
 
 
313 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.54 
 
 
326 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  34.92 
 
 
334 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  38.06 
 
 
308 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  37.7 
 
 
307 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  36.91 
 
 
312 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 
319 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  39.51 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  36.28 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.71 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  37.7 
 
 
316 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.33 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.8 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.92 
 
 
312 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.77 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  36.91 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.15 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  34.62 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  36.86 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.38 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
317 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 
309 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  34.74 
 
 
317 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
317 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  32.69 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  36.31 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  35.22 
 
 
317 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 
319 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  33.12 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  35.56 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 
300 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.39 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 
322 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  34.06 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 
319 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.93 
 
 
313 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  34.69 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.93 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  30.46 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  30.46 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  30.46 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  35.07 
 
 
323 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  33.55 
 
 
338 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  38.84 
 
 
284 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.94 
 
 
320 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.21 
 
 
319 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  30.57 
 
 
319 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  33.44 
 
 
316 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
319 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.48 
 
 
307 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 
333 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.87 
 
 
326 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.33 
 
 
344 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.1 
 
 
307 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 
319 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  27.73 
 
 
319 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>