223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2025 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  65.5 
 
 		 509 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 507 aa  1052    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.12 
 
 		 496 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.82 
 
 		 498 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.27 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.75 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.83 
 
 		 495 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 502 aa  232  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.3 
 
 		 502 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.25 
 
 		 564 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  27.97 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.56 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  28.47 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.35 
 
 		 479 aa  173  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.38 
 
 		 514 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.45 
 
 		 555 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.52 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.06 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.57 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.07 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.44 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  25.38 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.05 
 
 		 513 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.38 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  41.76 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.87 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.38 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.77 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.58 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.43 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  36.43 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.41 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.22 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.06 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.82 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.7 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 398 aa  67  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.53 
 
 		 412 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.07 
 
 		 377 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.87 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.1 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.28 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.05 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  25.97 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.2 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  33.62 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.65 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  32.81 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.09 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.24 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  33.64 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  35.87 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.2 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  33.91 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.97 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  26.19 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  33.91 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  31.72 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  31.72 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.97 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.16 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.39 
 
 		 361 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.76 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  33.94 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  32.97 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  33.94 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  31.19 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0834  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.07 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  44.44 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.17 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  28.8 
 
 		 356 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.81 
 
 		 247 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.06 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.99 
 
 		 367 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 508 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 267 aa  53.9  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 267 aa  53.9  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  21.89 
 
 		 348 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  30 
 
 		 328 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.8 
 
 		 391 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>