41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1363 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  93.9 
 
 		 174 aa  293  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  93.29 
 
 		 174 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  93.29 
 
 		 174 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  79.89 
 
 		 172 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  76.54 
 
 		 175 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  76.54 
 
 		 175 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  65.22 
 
 		 166 aa  200  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  59.2 
 
 		 167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  65.22 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  59.77 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  33.14 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  37.96 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  37.96 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  27.14 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  24.82 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  34.26 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  31.71 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  23.27 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  23.27 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  45.33 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  34.75 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  50.85 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  44 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  31.18 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  54.35 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  45 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  35.14 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  54.29 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  54.29 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  34.48 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  23.53 
 
 		 261 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  51.43 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  36 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  37.74 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  33.93 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  36.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>