35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1787 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  29.75 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  33.98 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  32.43 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  26.02 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  33.85 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  25.56 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  26.32 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  25.44 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  27.97 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  27.61 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  30.43 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  28.68 
 
 
169 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  31.03 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  26.24 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  47.5 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  47.5 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  27.66 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  35.09 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  26.9 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  47.22 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  30.28 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  45 
 
 
182 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  42.5 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  42.5 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  39.13 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  27.03 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  42.5 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  20.72 
 
 
180 aa  42  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  40.48 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  24.62 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0314425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>