43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0969 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  321  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  140  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  34.85 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  33.11 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  30.25 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09368  hypothetical protein  26.17 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.336108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  30.56 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  24.59 
 
 
198 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  28.83 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  26.56 
 
 
191 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  24.78 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  24.78 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  27.4 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  24.66 
 
 
197 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  30.65 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  38.33 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  30.65 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  21.95 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  27.5 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  31.03 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  32.76 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  32.76 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  47.22 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3193  hypothetical protein  28.92 
 
 
193 aa  43.9  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  32.76 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  26.32 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  42 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  44 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  42 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  23.68 
 
 
196 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  37.25 
 
 
180 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  28.04 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  28.07 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  23.81 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>