33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1460 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  61.04 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  61.04 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  56.77 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  53.59 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  55.28 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  59.74 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  44.37 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  28.47 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  27.41 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  32.18 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  24.48 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  24.84 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  25.52 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  25.52 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  32.39 
 
 		 169 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  30.86 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  21.8 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  31.88 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  23.24 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  29.57 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  37.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  31.88 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>