27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02766 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  349  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  76 
 
 
175 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  58.39 
 
 
174 aa  195  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  57.76 
 
 
174 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  32.43 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  32.43 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  31.53 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  31.68 
 
 
261 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  30.36 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  28.88 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  29.07 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  35.87 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  23.98 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  28.65 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  23.53 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  28.45 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  28.45 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  28.85 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  25.58 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  24.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  26.99 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  24.84 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  35.09 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  35.09 
 
 
184 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  35.09 
 
 
184 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  40.48 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  28.33 
 
 
140 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>