34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1967 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  38.57 
 
 
167 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  34.57 
 
 
175 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  34.57 
 
 
175 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  33.15 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  35.03 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  35.03 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  35.03 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  36.96 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  36.96 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  35.11 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  35.11 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  26.8 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  27.81 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  30.49 
 
 
175 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  24.05 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  23.85 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  21.55 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  20.99 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  28.46 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  25.34 
 
 
261 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  32.5 
 
 
189 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  34.21 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  37.68 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  25.6 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  40.98 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  24.03 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  36.11 
 
 
201 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  38.71 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  38.71 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  26.61 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>