20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0281 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  31.45 
 
 
180 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  34.38 
 
 
166 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  27.1 
 
 
182 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  27.15 
 
 
167 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  28.71 
 
 
165 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  25.34 
 
 
172 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  24.69 
 
 
178 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  25.34 
 
 
175 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  25.34 
 
 
175 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  27.87 
 
 
175 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  21.88 
 
 
174 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  32.48 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  26.25 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  27.54 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  35.94 
 
 
159 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  20.31 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  23.3 
 
 
174 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  26.09 
 
 
170 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  23.26 
 
 
166 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>