32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2525 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  27.81 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  26.32 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  36.71 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  34.72 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  28.95 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  30.53 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  32.88 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  29.47 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  29.47 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  28.09 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  32.43 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  33.9 
 
 		 175 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  33.87 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  39.13 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  26.25 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  26.92 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  43.24 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  24.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  23.81 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  40.54 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  44.74 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  44.74 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>