28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2850 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  27.69 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  25.16 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  27.15 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  26.49 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  25.19 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  24.44 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  22.4 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  29.89 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  23.61 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  27.5 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  20.9 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  28.09 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  24.63 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  36.96 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  31.76 
 
 		 261 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  42  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  35.19 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>