37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1988 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  48.94 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  25.71 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  24.6 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  26.5 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  39.22 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  31.94 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  30.68 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  32.39 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  29.77 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  39.22 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  30.19 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  30.56 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  32.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  38.46 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  29.58 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  28.17 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  33.96 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  29.58 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  24 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  31.88 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  26.39 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  26.39 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  28.17 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  32.56 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  32.56 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0419  hypothetical protein  29.52 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000206114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  32.56 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  30.91 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>