36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2762 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  48.84 
 
 
158 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  31.06 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  26.43 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  30.86 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  33 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  33 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  39.62 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  29.63 
 
 
198 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  30.97 
 
 
197 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  29.73 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  29.73 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  38.6 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  24.39 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  25.52 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  32.73 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  32.08 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  36.54 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  41.86 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  37.29 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  35.94 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  41.86 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  35 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  24.14 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  25.37 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  22.76 
 
 
196 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  31.67 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>