26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1572 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  62.05 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  60.84 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  58.16 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  52.87 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  52.87 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  56.38 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  40.76 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  32.67 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  38.54 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  32.08 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  32.35 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  29.51 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  29.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  24.83 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  29.46 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  29.46 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  25.62 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  30.83 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  24.65 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>