46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1011 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  90.74 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  62.09 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  50.57 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  52.87 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  43.51 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  30.33 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  27.35 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  31.31 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  30.47 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  29.36 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  29.03 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  29.6 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  29.03 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  26.36 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  26.15 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  30.1 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  33 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  25.62 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  54.29 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  37.04 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  54.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  54.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  54.29 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  26.89 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  31.52 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  32.76 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  30.34 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  46.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  41.86 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  47.37 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  47.37 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  47.37 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  44.19 
 
 		 167 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  27.91 
 
 		 184 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>