16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1072 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  346  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  30.15 
 
 
197 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  29.5 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  25.58 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  31.51 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  25.18 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  32.81 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  31.73 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  38.6 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  27.54 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  25.17 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  22.58 
 
 
165 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  31.67 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  37.31 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>