20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0167 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  96.55 
 
 
174 aa  345  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  61.87 
 
 
180 aa  187  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  55.86 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  27.52 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  23.6 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  26.22 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  26.22 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  26.22 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  20.99 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  22.36 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  22.36 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  29.6 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  29.17 
 
 
174 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  30.34 
 
 
165 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  31.46 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  20.31 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  29.41 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  23.31 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  22.06 
 
 
182 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>