31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  64.2 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  63.35 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  63.35 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  67.47 
 
 		 165 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  65.22 
 
 		 174 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  65.22 
 
 		 174 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  65.22 
 
 		 174 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  60.49 
 
 		 182 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  60.49 
 
 		 167 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  65.22 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  32.91 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  24.65 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  34.31 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  22.38 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  32.35 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  35.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  32.35 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  40.62 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  41.07 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  24.85 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  24.24 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  28.24 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  39.29 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  26.25 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>