23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1426 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  28.03 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  26.75 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  26.8 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  25.53 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  25.53 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  23.45 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  30.48 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  23.08 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  23.08 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  23.08 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  23.08 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  20.45 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  34.38 
 
 
261 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  20.9 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  29.6 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  28.8 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1794  hypothetical protein  36.92 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2791  hypothetical protein  34.33 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  23.29 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  27.47 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>