24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0178 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  343  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  77.7 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  54.6 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  53.99 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  25.97 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  33.03 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  33.03 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  24.8 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  32.11 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  33.03 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  36.26 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  26.99 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  26.99 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  32.14 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  31.2 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  30.28 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  28.76 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  25.55 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  21.26 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  26.09 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  33.9 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0734  hypothetical protein  28.1 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.978675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>