22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06805 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  42.18 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  33.02 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  31.16 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09368  hypothetical protein  25.89 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.336108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  29.75 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  30.14 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  24.09 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  31.34 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  29.85 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  36.96 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  34.55 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  33.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1556  hypothetical protein  26.47 
 
 		 202 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  hitchhiker  0.00000574427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  34.55 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  26.39 
 
 		 173 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  21.49 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  22.35 
 
 		 184 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>