27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4668 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  360  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  88.49 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  72.19 
 
 		 196 aa  233  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  60.32 
 
 		 198 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  69.5 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  69.5 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  50.36 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  44.37 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  34.97 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  26.09 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  26.09 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  28.37 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  24.82 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  29.9 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  23.85 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  27.66 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  26.8 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  26.56 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  27.56 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  31.21 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  25.98 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  25.98 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  26.51 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  28.92 
 
 		 184 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  28.92 
 
 		 184 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  26.03 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  23.02 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>