49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4778 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  88.49 
 
 
180 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  65.83 
 
 
198 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  73.2 
 
 
196 aa  234  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  62.81 
 
 
198 aa  231  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  74.47 
 
 
198 aa  230  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  50.36 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  40.22 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  35.19 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  28.99 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  28.26 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  26.92 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  31.96 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  29.08 
 
 
169 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  26.27 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  29.9 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  30.47 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  30.47 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  23.13 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  30.12 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  29.85 
 
 
178 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  28.89 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  27.4 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  34.62 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  34.62 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  32.05 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  35.48 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  31.18 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  31.52 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  22.31 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  31.52 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  31.18 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  38.64 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  34.92 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  34.92 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>