29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0880 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  52.07 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  42.65 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  44.03 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  41.01 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  40.54 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  39.01 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  39.01 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  37.31 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  24.83 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  26.99 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  26.17 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  22.9 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  26.43 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  27.41 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  22.31 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  31.64 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  22.63 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  24.35 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  24.83 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  26.09 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  26.56 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  25.86 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  25.27 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  26.32 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  25.27 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  25.27 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>