30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3484 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  65.94 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  60 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  66.15 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  59.77 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  59.33 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  56.32 
 
 		 169 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  31.3 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  30.22 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  30.94 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  30.94 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  29.05 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  28.26 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  26.09 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  23.13 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  25.55 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  29.06 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  28.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  29.79 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  26.76 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  26.89 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  26.89 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  28.74 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  42.5 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  28.28 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>