18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3141 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  317  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  44.83 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  34.43 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  40.54 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  34.43 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  35.85 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  35.24 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  37.33 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  28.04 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  34.43 
 
 
202 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  37.33 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  34.91 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  35.53 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  39.19 
 
 
201 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  32 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  35.06 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>