29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0739 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  89.11 
 
 
200 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  88.12 
 
 
200 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  79.7 
 
 
199 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  79.21 
 
 
199 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  79.21 
 
 
200 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  79.21 
 
 
198 aa  299  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  79.21 
 
 
200 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  79.21 
 
 
198 aa  299  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  79.21 
 
 
200 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  79.21 
 
 
198 aa  299  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  79.21 
 
 
199 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  79.21 
 
 
199 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  79.21 
 
 
198 aa  299  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  79.21 
 
 
198 aa  299  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  79.7 
 
 
198 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  78.22 
 
 
200 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  78.22 
 
 
199 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  46.84 
 
 
187 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0772  putative signal peptide protein  46.15 
 
 
186 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253516  decreased coverage  0.00200061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0843  signal peptide protein  46.15 
 
 
186 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  44.95 
 
 
190 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  53.42 
 
 
189 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  40.91 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  29.87 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  27.91 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  47.37 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  47.37 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>