28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0952 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  98.99 
 
 
198 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  91.46 
 
 
199 aa  348  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  91 
 
 
200 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  90.95 
 
 
199 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  90.95 
 
 
199 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  90.95 
 
 
199 aa  345  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  88 
 
 
200 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  87.94 
 
 
199 aa  334  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  84 
 
 
200 aa  316  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  83 
 
 
200 aa  315  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  79.21 
 
 
202 aa  299  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  50 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0843  signal peptide protein  49.21 
 
 
186 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0772  putative signal peptide protein  49.21 
 
 
186 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253516  decreased coverage  0.00200061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  47.42 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  47.31 
 
 
189 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>