25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0902 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0843  signal peptide protein  86.7 
 
 		 186 aa  324  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0772  putative signal peptide protein  86.17 
 
 		 186 aa  322  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253516  decreased coverage  0.00200061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  72.73 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  70.79 
 
 		 189 aa  250  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  48.21 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  48.21 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  48.21 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  48.21 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  47.69 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  46.91 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  46.91 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  48.72 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  48.72 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  45.96 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  24.42 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>