33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0085 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  98.51 
 
 		 201 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  86.84 
 
 		 203 aa  274  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  51.49 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  32.03 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  42.05 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  38.78 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  42.05 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  38.3 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  38.3 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  34.43 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  37.82 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  40.91 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  35.78 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  26.81 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  33.94 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  31.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3193  hypothetical protein  33.06 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  73.08 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  55.26 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1619  hypothetical protein  36.62 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  33.06 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  25.93 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  39.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  27.18 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  38.24 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  33.33 
 
 		 190 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  21.98 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>