More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5404 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  97.78 
 
 		 586 aa  1080    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  95.56 
 
 		 586 aa  1065    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  87.35 
 
 		 587 aa  996    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  98.98 
 
 		 586 aa  1139    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  88.36 
 
 		 587 aa  994    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  64.78 
 
 		 585 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  89.74 
 
 		 587 aa  997    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  84.13 
 
 		 585 aa  967    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  61.95 
 
 		 586 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  63.23 
 
 		 585 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 586 aa  1149    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  84.47 
 
 		 585 aa  989    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  63.57 
 
 		 585 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 		 710 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  50.75 
 
 		 741 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  47.88 
 
 		 745 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  50.13 
 
 		 747 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  44.36 
 
 		 741 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  45.64 
 
 		 757 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  41.88 
 
 		 782 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 771 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 		 764 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  34.39 
 
 		 777 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 671 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 		 673 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 		 762 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 773 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  34.21 
 
 		 684 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 775 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 771 aa  193  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.07 
 
 		 567 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 567 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  33.51 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  32.34 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 		 652 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 674 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 667 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  32.22 
 
 		 575 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 674 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  31.96 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 		 585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  33.85 
 
 		 555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 606 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  33.43 
 
 		 650 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  34.29 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 613 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  30.93 
 
 		 563 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  30.93 
 
 		 563 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.59 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.14 
 
 		 588 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.59 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 558 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  32.36 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  33.59 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  31.44 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  33.59 
 
 		 561 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  30.93 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4142  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 405 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4030  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 405 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 741 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.33 
 
 		 582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  31.55 
 
 		 576 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  32.04 
 
 		 574 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  31.14 
 
 		 569 aa  173  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  32.64 
 
 		 561 aa  173  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 		 664 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  32.9 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.34 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.94 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  31.14 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 572 aa  170  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 595 aa  169  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  33.62 
 
 		 665 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  33.62 
 
 		 665 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 664 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  30.95 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 		 662 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>