More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4142 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  92.35 
 
 		 405 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4142  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 405 aa  771    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4030  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 405 aa  771    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  69.85 
 
 		 408 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  68.52 
 
 		 575 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  69.8 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  67.86 
 
 		 563 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  67.86 
 
 		 563 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  68.11 
 
 		 563 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  67.33 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  67.6 
 
 		 562 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  67.33 
 
 		 567 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  67.77 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  66.67 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  65.92 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  69.8 
 
 		 574 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  65.92 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  68.29 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  65.76 
 
 		 606 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  65.27 
 
 		 606 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  66.84 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  66.84 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  66.84 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  66.84 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  66.84 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  68.18 
 
 		 541 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  66.58 
 
 		 558 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  65.82 
 
 		 558 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  64.71 
 
 		 576 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  67.92 
 
 		 678 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  62.9 
 
 		 566 aa  478  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  67.18 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  63.14 
 
 		 585 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  62.92 
 
 		 624 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  65.59 
 
 		 619 aa  461  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  67.43 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  65.84 
 
 		 615 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  65.59 
 
 		 619 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  65.32 
 
 		 569 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  63.9 
 
 		 572 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  63.9 
 
 		 572 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  61.85 
 
 		 613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  65.75 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  65.5 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  65.5 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  59.06 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  63.29 
 
 		 565 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  60.15 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  63.24 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  64.43 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  66.24 
 
 		 607 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  60.25 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  59.55 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  62.01 
 
 		 579 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  59.49 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  62.18 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  59.16 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  62.78 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  62.31 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  60.56 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  60.56 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  60.56 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  59.27 
 
 		 577 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  62.66 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  59.49 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  60.31 
 
 		 572 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  59.65 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  60.05 
 
 		 571 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  58.65 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  60.05 
 
 		 571 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4379  sodium/hydrogen exchanger  58.96 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  53.55 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0048  putative potassium efflux system protein  61 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0369  putative potassium efflux system protein  61 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1059  putative potassium efflux system protein  61 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1216  putative potassium efflux system protein  61 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1194  potassium efflux system protein, putative  62.56 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0077476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  61.21 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  52.53 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1635  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  60.75 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  53.27 
 
 		 588 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  52.26 
 
 		 631 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0220  potassium-efflux system protein  61 
 
 		 695 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.559394  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  49.38 
 
 		 581 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  49.11 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 		 684 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2272  sodium/hydrogen exchanger  48.18 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.668389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  47.73 
 
 		 674 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2030  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.14 
 
 		 509 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  42.42 
 
 		 662 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  40.62 
 
 		 671 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  39.7 
 
 		 673 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>