More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1071 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  277  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  99.26 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  98.52 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  98.51 
 
 		 135 aa  271  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  86.57 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  84.33 
 
 		 141 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  84.33 
 
 		 141 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  75.94 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  64.84 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  66.15 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 154 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  67.74 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  67.74 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  67.74 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  67.74 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  67.2 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  63.2 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  59.23 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  61.29 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  56.8 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  61.02 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  50 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  46.36 
 
 		 263 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 260 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 176 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 175 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.39 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.86 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.86 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.86 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.86 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.96 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.96 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.96 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  35.71 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.61 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  36.97 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.63 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.94 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  32.74 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  32.11 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.24 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  42.24 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  42.24 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  42.24 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>