More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3106 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  59.33 
 
 		 168 aa  194  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  58.71 
 
 		 168 aa  190  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  58.49 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  60.27 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  56.76 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  57.79 
 
 		 165 aa  180  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  57.79 
 
 		 165 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  56.85 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  54.04 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  54.04 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  56.67 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  51.06 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  53.62 
 
 		 147 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  52.89 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  46.43 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  52.89 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  45.32 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  51.24 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  45.18 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.67 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  42.24 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  44.52 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  42.94 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  42.28 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  45.21 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.5 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  50 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  46.88 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  42.55 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  39.51 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.87 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  39.87 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  45 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  38.96 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  42.96 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  51.3 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.94 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  41.78 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.24 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  42.86 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.98 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.98 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.2 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.24 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  35.98 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  41.22 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.51 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  43.7 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  41.22 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  39.74 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.24 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  38.26 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.79 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.76 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  40.74 
 
 		 148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  40.27 
 
 		 533 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.61 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.76 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  39.07 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.31 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.91 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.31 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.31 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.81 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.31 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  43.17 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  42.54 
 
 		 518 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.73 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  41.48 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  39.57 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.03 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  43.17 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.15 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  37.78 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>