More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2307 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 154 aa  316  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  73.38 
 
 		 172 aa  247  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  74.13 
 
 		 143 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  69.28 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1870  translation initiation factor IF-3  79.22 
 
 		 157 aa  219  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000408645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1991  translation initiation factor IF-3  73.13 
 
 		 138 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.386988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2627  translation initiation factor IF-3  76.87 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  53.9 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  53.33 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.9 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  52 
 
 		 207 aa  181  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  54 
 
 		 198 aa  181  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 238 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  55.78 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 190 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 173 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.32 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  51.3 
 
 		 173 aa  176  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 		 181 aa  176  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 202 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  53.69 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 198 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  53.02 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  49.02 
 
 		 184 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  50 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.66 
 
 		 175 aa  174  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.67 
 
 		 222 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  50.33 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 219 aa  171  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 178 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 199 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 187 aa  170  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 196 aa  170  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 225 aa  169  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 205 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50 
 
 		 225 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 202 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 194 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 252 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  55.03 
 
 		 229 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 201 aa  167  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 186 aa  166  7e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 250 aa  166  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 173 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 173 aa  166  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 194 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 194 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 176 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  53.64 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 233 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 178 aa  164  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 		 169 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 192 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 174 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  51.95 
 
 		 205 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 232 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 194 aa  164  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 230 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>