More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1870 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1870  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 157 aa  317  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000408645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  79.22 
 
 		 154 aa  258  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  74.36 
 
 		 172 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  76.77 
 
 		 173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  76.22 
 
 		 143 aa  225  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1991  translation initiation factor IF-3  80.45 
 
 		 138 aa  214  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.386988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2627  translation initiation factor IF-3  80.45 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  56.13 
 
 		 238 aa  189  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.77 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  55.13 
 
 		 173 aa  186  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  54.49 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  51.95 
 
 		 179 aa  184  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  54.3 
 
 		 197 aa  184  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 219 aa  184  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 225 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  56.46 
 
 		 154 aa  183  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 174 aa  183  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  55.19 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  57.72 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 190 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  53.59 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 184 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  53.21 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.25 
 
 		 145 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 165 aa  179  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 202 aa  179  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.63 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 232 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 230 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  51.92 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.32 
 
 		 207 aa  177  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  52.56 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 180 aa  176  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  60.13 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  54.84 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  55.77 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 		 198 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  57.52 
 
 		 229 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 198 aa  173  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 190 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 		 194 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  48.37 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 173 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 182 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  49.02 
 
 		 173 aa  169  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  49.36 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 177 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 183 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 173 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 183 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 		 205 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 183 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 176 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  56.05 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>