More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1578 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 556 aa  1105    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  59.2 
 
 		 554 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  56.76 
 
 		 558 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  56.57 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  57.79 
 
 		 553 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  57.17 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  57.71 
 
 		 553 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  46.45 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.97 
 
 		 577 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  39.05 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  41.11 
 
 		 572 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.01 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  38.1 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 579 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 579 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  37.76 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.69 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38 
 
 		 573 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  42.6 
 
 		 558 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 580 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  37.83 
 
 		 605 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  42.09 
 
 		 611 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  39.3 
 
 		 555 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  39.11 
 
 		 601 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 552 aa  349  9e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  42.36 
 
 		 606 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  346  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 563 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  42.68 
 
 		 606 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  42.5 
 
 		 606 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.65 
 
 		 568 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 		 559 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.33 
 
 		 556 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.57 
 
 		 555 aa  339  8e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.9 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  38.16 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.35 
 
 		 562 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.5 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.77 
 
 		 555 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 599 aa  332  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.92 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 		 558 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  37.07 
 
 		 553 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  36.89 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  36.53 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  36.53 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  36.53 
 
 		 553 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  36.53 
 
 		 553 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 554 aa  330  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.83 
 
 		 560 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 552 aa  329  7e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  36.89 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  36.89 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  36.89 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  36.46 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  36.05 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.17 
 
 		 553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  36.17 
 
 		 553 aa  327  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  36.46 
 
 		 553 aa  326  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  34.78 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.72 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.12 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 		 551 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.11 
 
 		 589 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>