More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2860 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  73.73 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  59.69 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  48.72 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  61.7 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  55 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  45.19 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  47.06 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.14 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  44.9 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.32 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 		 269 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.89 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  36 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  35.64 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  33.66 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.35 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  38.82 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  33.66 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.24 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.71 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.96 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.33 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.23 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.65 
 
 		 395 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  39.08 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  34.65 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.41 
 
 		 565 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.5 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.78 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.5 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A35  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.634534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.74 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.93 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.11 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  36.11 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.11 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.03 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 		 387 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  36.11 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  32.95 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  38.75 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 480 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  40 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.11 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.5 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 356 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  34.34 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.02 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.46 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.75 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>