More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2098 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  78.52 
 
 
582 aa  873  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
584 aa  1153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  81.83 
 
 
585 aa  952  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  86.28 
 
 
584 aa  964  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  83.91 
 
 
586 aa  952  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  39.59 
 
 
674 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 
741 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.95 
 
 
697 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 
665 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 
672 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
665 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
636 aa  358  2e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 
658 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 
666 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  36.4 
 
 
688 aa  346  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.04486e-09  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  37.92 
 
 
682 aa  340  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 
664 aa  338  2e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 
666 aa  332  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.1 
 
 
670 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  37.63 
 
 
666 aa  330  5e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.62 
 
 
671 aa  328  2e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.2 
 
 
663 aa  326  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 
666 aa  320  4e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 
668 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  37.64 
 
 
656 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  36.94 
 
 
672 aa  315  2e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
676 aa  314  3e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 
664 aa  299  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 
577 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
693 aa  284  3e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  36.38 
 
 
679 aa  283  6e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  36.03 
 
 
660 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 
660 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
668 aa  274  4e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 
668 aa  273  4e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
668 aa  273  5e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
668 aa  273  5e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 
678 aa  273  5e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
667 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 
674 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 
670 aa  271  3e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  32.42 
 
 
663 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
670 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
659 aa  270  6e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.63 
 
 
652 aa  270  6e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
652 aa  270  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
667 aa  270  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 
775 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.47 
 
 
669 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.47 
 
 
669 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.47 
 
 
669 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.47 
 
 
669 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  32.47 
 
 
669 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  32.47 
 
 
663 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  33.64 
 
 
666 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.84 
 
 
669 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  36.15 
 
 
457 aa  267  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 
666 aa  266  6e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
567 aa  262  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
567 aa  262  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  30.54 
 
 
662 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
773 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
673 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.39 
 
 
588 aa  260  5e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.23 
 
 
567 aa  259  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.84 
 
 
680 aa  259  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.67 
 
 
648 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  31.79 
 
 
649 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  30.38 
 
 
648 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.55 
 
 
648 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
771 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
762 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  30.29 
 
 
648 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  30.29 
 
 
648 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  29.88 
 
 
648 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 
656 aa  255  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  29.88 
 
 
648 aa  255  2e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  29.88 
 
 
648 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  31.61 
 
 
650 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.8 
 
 
543 aa  253  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 
661 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.56 
 
 
649 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  31.91 
 
 
661 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
649 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  29.42 
 
 
648 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 
671 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.53 
 
 
539 aa  247  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  5.29307e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
583 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  31.4 
 
 
616 aa  246  1e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30.05 
 
 
650 aa  245  2e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
667 aa  245  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  34.2 
 
 
658 aa  244  4e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
594 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 
661 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 
661 aa  242  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
657 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
584 aa  241  3e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.03 
 
 
720 aa  241  3e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
665 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
665 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>