More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0841 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
337 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  66.57 
 
 
359 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  61.86 
 
 
358 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  59.47 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  57.36 
 
 
355 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  58.43 
 
 
353 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  52.11 
 
 
350 aa  362  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
337 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  40.72 
 
 
338 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.73 
 
 
322 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
339 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  38.89 
 
 
336 aa  204  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  36.22 
 
 
330 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  39.63 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 
325 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
318 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
334 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.35 
 
 
838 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.4 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
841 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
836 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
822 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
337 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
312 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
312 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
321 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.8 
 
 
283 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
320 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
841 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
345 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.07 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
346 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
290 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
291 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
366 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
336 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.51 
 
 
860 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
288 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  30.94 
 
 
323 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
311 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
307 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
296 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
302 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
296 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
296 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
286 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.62 
 
 
284 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.02 
 
 
291 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
331 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
282 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
345 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
279 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
430 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
312 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
305 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
325 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
291 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
308 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
332 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
525 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
294 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
343 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
1340 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
1267 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
722 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
951 aa  95.9  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>