More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1027 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  100 
 
 
440 aa  878    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  53.21 
 
 
435 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  53.44 
 
 
435 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  52.05 
 
 
434 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.97 
 
 
426 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  48.05 
 
 
439 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.54 
 
 
427 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.1 
 
 
428 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.13 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  44.72 
 
 
428 aa  322  8e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.03 
 
 
432 aa  320  5e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  44.85 
 
 
428 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  44.16 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.62 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.78 
 
 
438 aa  312  7.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.32 
 
 
425 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 
425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  43.02 
 
 
437 aa  308  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  41.67 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  50.9 
 
 
352 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.02 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  43.47 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  57.41 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  43.02 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  43.02 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  43.92 
 
 
437 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.02 
 
 
428 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.14 
 
 
372 aa  302  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.83 
 
 
429 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.34 
 
 
346 aa  302  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  43.02 
 
 
428 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  44.93 
 
 
419 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.43 
 
 
372 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.15 
 
 
373 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.56 
 
 
428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.41 
 
 
422 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.79 
 
 
427 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.01 
 
 
426 aa  299  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.89 
 
 
437 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.85 
 
 
370 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.28 
 
 
369 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  46.3 
 
 
402 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.56 
 
 
373 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.08 
 
 
482 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.81 
 
 
417 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.21 
 
 
365 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  53.89 
 
 
348 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.07 
 
 
350 aa  296  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.3 
 
 
338 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.41 
 
 
435 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.31 
 
 
338 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.21 
 
 
365 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.2 
 
 
353 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  45.73 
 
 
397 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  48.97 
 
 
370 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  47.59 
 
 
350 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.36 
 
 
397 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  48.13 
 
 
406 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.65 
 
 
387 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.32 
 
 
338 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.38 
 
 
424 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.64 
 
 
370 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.74 
 
 
338 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.15 
 
 
364 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.35 
 
 
439 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  47.65 
 
 
353 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48 
 
 
338 aa  289  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.9 
 
 
338 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.96 
 
 
463 aa  289  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  51.5 
 
 
370 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  51.5 
 
 
370 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  51.5 
 
 
370 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.68 
 
 
415 aa  289  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.25 
 
 
347 aa  289  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  49.55 
 
 
362 aa  289  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  47.88 
 
 
343 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  40.41 
 
 
433 aa  288  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  51.96 
 
 
397 aa  289  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.85 
 
 
364 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 
348 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.73 
 
 
336 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.15 
 
 
341 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.94 
 
 
345 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.74 
 
 
454 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.15 
 
 
341 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  47.38 
 
 
351 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  42.47 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  47.58 
 
 
366 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  42.47 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  50.31 
 
 
370 aa  286  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>