60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0089 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  34.29 
 
 
207 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  37.4 
 
 
206 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  34.29 
 
 
236 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  33.79 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  34.4 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  29.73 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  29.73 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  32.81 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  30.22 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  29.69 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  30.47 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  29.92 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  31.29 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  27.7 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  31.61 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  35.04 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  31.01 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  30.2 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  30.52 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  30.89 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  27.64 
 
 
249 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  28.78 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  29.24 
 
 
280 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  27.2 
 
 
227 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  30.63 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  39.08 
 
 
121 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  31.67 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  27.03 
 
 
247 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  24.39 
 
 
265 aa  47.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
349 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  27.42 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  23.93 
 
 
247 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
317 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  26.26 
 
 
328 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  29.27 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
327 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 
251 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
339 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.07 
 
 
259 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  23.58 
 
 
265 aa  44.3  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
265 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  23.96 
 
 
252 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  29.93 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43583  predicted protein  38.98 
 
 
224 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  24.71 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  27 
 
 
341 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  33.85 
 
 
415 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0575  hypothetical protein  35.06 
 
 
247 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.25 
 
 
443 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  33.93 
 
 
333 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  25.53 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  24.24 
 
 
335 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.53 
 
 
281 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 
287 aa  40.8  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>